Чарльз Ротшильд был партнёром в семейном банке N M Rothschild & Sons, а также крупным натуралистом и энтомологом, авторитетным специалистом по блохам. Он считается одним из первых борцов за охрану природы, основателем Общества содействия природным резервам.

В 1907 г. Чарльз женился на венгерской баронессе и спортсменке Розике Эдл (1870 - 1940), наследнице старинного австрийско-еврейского рода, получившего дворянство задолго до Ротшильдов. У них было четверо детей. Супруги совместно совершали поездки на природу, в том числе в Карпатские горы, где Чарльз коллекционировал бабочек.

Чарльз Ротшильд был мировым судьей графства Нортгемптоншир (1902), верховным шерифом этого графства (1905), служил в должности лейтенанта лондонского Сити. Он такжеинтересовался заводом по переработке золота, который принадлежал Ротшильдам, и изобрёл ряд устройств для работы с золотом с научной точки зрения. Он также был председателем страховой компании Alliance Assurance Company.

В 1901 г. во время очередной экспедиции Чарльз обнаружил в Египте и впервые описал главного распространителя чумы - крысиную блоху Xenopsylla cheopis Rothschild. Он опубликовал десятки научных статей и собрал крупнейшую коллекцию блох и других насекомых, которая зранится в Британском музее.

Страдая от энцефалита, Чарльз Ротшильд в возрасте 46 лет совершил самоубийство

Имя Натаниэль - английская форма библейского имени Нафанаил - "дар Божий". Имя Чарльз - английская форма германского имени Карл, происходящего от слова Karlaz со значением "свободный человек". Фамилия Ротшильд означает "красный щит" на немецком.